در سال ۱۳۷۴ تشکیل آموزشکده پیراپزشکی و همچنین پذیرش در دو رشته علوم آزمایشگاهی بهداشت عمومی(گرایش بهداشت خانواده) به شورای گسترش پیشنهاد گردید. در سال ۱۳۷۴ ایجاد دو رشته فوق الذکر مورد موافقت شورای گسترش قرار گرفت و در نهایت در سال ۱۳۷۵ با تاسیس آموزشکده پیراپزشکی موافقت قطعی به عمل آمد.
در سال ۱۳۷۵ و بعد از تاسیس آموزشکده پیراپزشکی گرگان دو رشته اتاق عمل و هوشبری که زیر مجموعه رشته های پیراپزشکی محسوب می شوند از دانشکده پرستاری بویه منفک و به آموزشکده پیراپزشکی ملحق گردید. همچنین در سال ۱۳۷۹ رشته های بهداشت محیط در مقطع کاردانی و در سال ۱۳۸۰ رشته مبارزه با بیماریها نیز به جمع رشته های آموزشکده اضافه گردیدند.
در تیر ماه ۱۳۸۶ بر اساس مصوبه هیئت امنا دانشگاه و همچنین براساس مصوبه شورای گسترش دانشگاههای علوم پزشکی کشور در مورخه ۱۷/۸/۸۷، آموزشکده به دانشکده ارتقاء یافت.
در نیمسال دوم سال تحصیلی ۱۴۰۰-۱۳۹۹ پذیرش دانشجویان تحصیلات تکمیلی تخصصی (فلوشیپ) علوم آزمایشگاهی و به دنبال آن در سال نیمسال اول ۱۴۰۰-۱۴۰۱ پذیرش دانشجویان مقطع کارشناسی ارشد رشته قارچ شناسی پزشکی مجوز دریافت نمود و در حال حاضر در دانشکده مشغول به تحصیل می باشند.
در حال حاضر دانشکده پیراپزشکی در رشته اتاق عمل(مقطع کارشناسی)، هوشبری(مقاطع کارشناسی)، علوم آزمایشگاهی(کارشناسی)، فناوری اطلاعات سلامت (کارشناسی)، قارچ شناسی پزشکی(کارشناسی ارشد) و دوره تکمیلی تخصصی علوم آزمایشگاهی(فلوشیپ) دانشجومی پذیرد.